单纯的无机化肥的施用的弊端已经很明显，为了减少无机化肥的施用各种烟草肥料的开发和利用都在发展。充分发展有机-无机复合肥，微生物菌肥不仅能够改善土壤的理化性质，生物性状，有效地提高肥料利用率，减少土壤固定，改善后期营养，调节植株株代谢，增强根系吸收能力，提高作物品质。同时同时微生物菌剂中的有益微生物能够快速活化士壤养分，改善根际营养;能够提高土壤酶的活性;能够合成土壤腐殖质，促进团粒结构的形成:抑制有害菌系，增强植株的免疫能力，提高抗性具有无毒、无害、无污染、营养全、肥效长、充分利用现有资源等优点。因此微生物菌剂是我国今后肥料发展的重要一环。发展菌肥:菌肥作为新型肥料，人们对它的认识经历了很多阶段，现在人们都已意识到，菌肥相较于化肥有许多明显的优势。我国烟草种植区，除了部分烟田轮作外，烟田多一年一作，多年连作现象也比较多，烟田冬天裸露，水分损失比较大，而春季经常干旱，土壤墒情不足。如若能因地制宜地施用菌肥，可以起到养地，保水和改良土壤的效果。使用控释肥料和缓释肥料可以节省肥料，提高肥料的利用率。瓦廷氏利用硝酸钾包膜肥料在砂壤上试验取得了较好的效果。因而应当研制控释缓释钾肥，延长钾肥的供应时间，减少土壤的固定，提高肥料的利用率，减少施肥的次数。发展高浓度、高效的地区烟草专用复合肥。国产复合肥多数为中低浓度，今后应当选择合适的氮、磷、钾源，发展高度的复合肥，并进行有机和无机复合，并添加菌种、増效剂、土壤改良剂等，一肥多效，从而提高经济效益。